С. Шанкар начал свою карьеру в качестве помощника режиссеров, С.А. Чандрасекара и Павитрана. Его первой работой на хинди стал фильма "Jai Shiv Shankar", над которым он работал в качестве ассистента режиссера С.А Чандрасекара. В 1993 году он, наконец, дебютировал в качестве режиссера фильма "Gentleman". С Арджуном Сарджа в главной роли, фильм стал блокбастером. После этой картины, композитор А.Р. Рахман продолжил работать с Шанкаром в его следующих 6 режиссерских проектах.
Его второй фильм "Отстоять любовь", остросюжетная драма была выпущена в следующем году, главную роль сыграл Прабху Дева. "Отстоять любовь" также вызвал положительный отклик, затем добился успеха в прокате. В 1996 году режиссер сотрудничал с Камалом Хаасаном для фильма "Индиец". Фильм добился хороших отзывов от критиков и коммерческого успеха. Картина также была представлена в номинации на премию Оскар, как лучший иностранный фильм. После успеха "Индиец", Шанкар начал работать над фильмом "Невинная ложь", который был выпущен в 1998 году и стал самым дорогим индийским фильмом того времени. Также стал самым кассовым тамильским фильмов 1990-х годов. В качестве продюсера Шанкар дебютировал с фильмов "Mudhalvan" (1999), в котором ведущую роль сыграл Арджун Сарджа. Картина стала успешной в прокате. В то же время, режиссер начал работать над научно-фантастическим фильмом под названием "Робот", но проект был заморожен из-за большого бюджета. И он решил переделать "Mudhalvan" в хинди римейк под названием "Лидер", тем самым отметив дебют в Болливуде.
Его музыкальный фильм "Танцоры диско" вышедший на экраны в 2003 году, получил от критиков и зрителей неоднозначную реакцию и сделал среднюю кассу. А психологический триллер "Незнакомец", который показал Викрама в трех различных ролях (Амби, Ремо и Аниян) был выпущен в 2005 году. Композитором фильма был Харрис Джаярадж. "Незнакомец" стал вторым самым кассовым фильмов 2005 года. Вскоре после этого, Шанкар объединился с Раджникантом, АВМ Productions и А. Р. Рахманом для фильма "Крутой Шиваджи" с бюджетом 600 млн рупий, то есть самого дорого фильма того времени. Фильм был выпущен в 2007 году, после двух лет съемок и стал самым кассовым фильмом того года.
После "Шиваджи", Шанкар вновь начал работать над научно-фантастическим проектом, в котором главные роли исполнили Раджиникант и Айшвария Рай. Фильм был назван "Enthiran" и охватил бюджет 1,32 млрд рупий. Картина стала успешной в прокате. После этого режиссер снял "Друг", тамильский римейк "3 идиотов" Болливуда, который в итоге также добился кассового успеха. 21 июня 2012 года, Шанкар объявил о следующем фильме под названием "Я". В этом романтическом триллере, Викрам сыграл горбуна, который мстит своим бывшим коллегам из модной индустрии, которые его таким сделали. Картина вышла на экраны 14 января 2015 г. вызвал смешанные отзывы, но стал блокбастером, заработав Rs.200 рупий за 19 дней.
